La marjolaine est antiseptique, et dépigmentante. L'huile essentielle est utilisée pour ses vertus tonifiantes. Mais la marjolaine fraîche contrairement à son huile essentielle peut être irritante pour la peau. On l'utilise en cosmétique comme éclaircissant de la peau.

La marjolaine calme les nerfs. C'est une plante énergétique à forte dose, stimulante ou calmante à faible dose, la posologie devant être adaptée à l'individu.

la marjolaine est un excellent aromate, plus fin que l'Origan (avec lequel il est souvent confondu!). A la renaissance les femmes cultivaient la marjolaine dans des pots, en faisaient de la confiture ou du vin à la marjolaine.